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RNA sequencing


RNA-seq
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ご紹介


QIAseq テクノロジーは、RNAの世界での新しい発見を加速します。FFPEサンプルなど断片化が進んでいるRNA サンプルや微量のRNAなど困難なサンプルへの対応が可能なソリューションのご用意もあります。また、簡便な実験工程やコストパフォーマンスに優れた商品ラインナップもご用意しておりますので、時間と労力を節約頂けます。さらに、簡単無料なクラウドベースの解析ツールであるRNA-seq Analysis Portalは、複雑なNGSデータから生物学的な解釈を得るための最適ツールです。


QIAseq RNA Library kits対応
クラウド解析システム



RNA-seq Analysis Portal

誰でも使える無料のRNA-seqデータ解析システム

  • 一次解析から生物学的解釈まで、わずか3ステップで完了
  • シームレスなクラウドシステム
  • 基本的な発現差解析結果のグラフが取得可能
  • 統合された解析パイプラインによるパスウェイやバイオマーカーの発見
  • トップ10 のパスウェイ、上流のレギュレーター、および下流の疾患等の影響予測
  • 定評のあるQIAGEN Knowledge Baseに基づいたパスウェイ解析

    • 対象生物：　ヒト・マウス・ラットを含む18種類 (パスウェイ解析は非対応生物あり)

    対象キット
    QIAseq® Stranded mRNA Select Kit
    QIAseq® Stranded Total RNA Lib Kit
    QIAseq® miRNA Library Kit
    QIAseq® UPX 3' Transcriptome Kit
    QIAseq® UPXome RNA Lib Kit

    RNA-seq Analysis Portal ポータルページ

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    消耗品

    QIAseq FastSelect Kits
    高感度RNAseqに重要なrRNA除去やグロビンmRNA除去試薬

  • 逆転写前に添加するのみの少ステップで完了（バクテリア用製品を除く）
  • rRNAやグロビンmRNAの高い除去効率
  • FFPEなど分解したRNAに対応可
  • 哺乳類、バクテリア、植物、酵母、魚類、キイロショウジョウバエ、センチュウ対応

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    QIAseq Stranded RNA Library Kits
    全トランスクリプトーム解析に最適なストランド特異的 RNA-seq ライブラリー調製試薬 （Poly-A+ 濃縮にも対応）

  • QIAseq FastSelect Kitsとの組み合わせに最適
  • 100 ng から5 μg のトータルRNAに対応
  • Actinomycin D や dUTP の処理が不要
  • 精製用のQIAseq Beads とデュアルインデックスが同梱

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    QIAseq UPX 3’ Transcriptome Kits
    少量・分解 RNAに対応の3’トランスクリプトーム解析

  • 分子バーコードによる定量的な発現解析
  • セルIDにより簡単にハイスループット解析を実現
  • 少量の精製RNAまたは細胞からスタート可能
  • 96 ウェル（切り離し可能）、もしくは 384 ウェルプレートフォーマット

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    QIAseq UPXome RNA Library Kit
    少量 RNA から簡単なワークフローで実現するストランド特異的RNA-seq

  • 各種動物種に合わせたQIAseq FastSelect Kitsが同梱
  • セルIDと6時間で終了するワークフローによるハイスループット解析
  • 少量の精製RNAからスタート可能
  • 96 ウェル（切り離し可能）、もしくは 384 ウェルプレートフォーマット

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    QIAseq miRNA Library Kit
    リキッドバイオプシー対応のmiRNA用ライブラリー調製試薬

  • わずか1 ngの全RNAから対応
  • ゲル抽出不要で簡単なワークフロー
  • 分子バーコードによる定量的なmiRNA解析
  • 精製用のQIAseq Beadsが同梱

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    製品に関するお問い合わせはこちら

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    参考資料

    QIAseq を用いた RNA-seq 論文集

    NGS によるRNA-seq の方法論やがん・感染症を中心としたトランスクリプトーム解析の重要性を中心に、以下をテーマに最新の論文をご紹介します。
    • 3’ トランスクリプトーム解析の利点
    • リキッドバイオプシーにおけるmiRNA 解析の検討
    • 臨床検体におけるmiRNA バイオマーカーの探索
    • 感染症におけるmiRNA 解析の重要性
    • RNA-seq が解明する病原体および宿主応答
    QIAseq の疾患研究への応用やRNA-seq における分子バーコードの重要性など、RNA-seq に関連する情報が満載です。

    論文集PDF
    アプリケーションノート
    QIAseq FastSelect Kits
    rRNA およびグロビン mRNA 除去による マラリア感染症の効率的なメタトランスクリプトーム解析

    データ提供
    関 真秀 先生、今村 聖実 先生、鈴木 穣 先生
    東京大学大学院 新領域創成科学研究科 生命システム観測分野

    アプリケーションノートPDF

    カスタマーボイス

    QIAseq FastSelect Kits

    ゲノムリード株式会社
    谷口歯科医院・口腔常在微生物叢解析センター
    谷口 誠 先生
    「RNAの断片化の工程に、混ぜて、サーマルサイクラーの設定を追加するだけなので、非常に簡単なワークフローだと感じました。 ビーズ精製が必要なバクテリア用のFastSelectを除くと自動化も容易です。 HMRや植物だけでなく、他社からは発売されていない魚類や酵母など他の生物種にも対応したキットが出ているのも良いです。」
    東京大学大学院 理学系研究科
    生物科学専攻 RNA生物学研究室
    平形 樹生 先生
    「FastSelect Flyを使うことで、小分子RNAライブラリに混入する2S rRNAを0.2%未満にまで減らせました。 rRNAの除去効率に大変満足しています。」

    RNA-seq Analysis Portal / QIAseq UPX 3’Transcriptome Kits

    奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス領域 発生医科学 
    笹井 紀明 先生
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    「今回、マウス胚性幹細胞が分化する過程で働く遺伝子の機能を明らかにする目的で、遺伝子変異細胞を作成し、野生型細胞との遺伝子発現を比較しました。キアゲンのQIAseq UPX 3' Transcriptome Kitsを用い、わずか500万リードで定量的な情報を得ることに成功しました。またmRNAシーケンスの解析においては、パスウェイ解析のほか、ヒートマップ、火山型プロット（Volcano plot）の表示が必須とされるものの、これらは意外に大変です。しかしRNA-seq Analysis Portal (RAP)には必要な情報のすべてが一画面上にわかりやすく表示されているため、簡単に解析・描画ができ、十分に説得力のある図が作成できました。 」

    掲載論文

    The Rx transcription factor is required for determination of the retinal lineage and regulates the timing of neuronal differentiation.
    Yamamoto M, Ong ALC, Shinozuka T, Sasai N.Dev Growth Differ. 2022 Aug;64(6):318-324. doi: 10.1111/dgd.12796. Epub 2022 Jun 30.

    オンデマンドウェビナー

    RNA-seq Analysis Portal / QIAseq UPX 3’Transcriptome Kits

    オンデマンドウェビナー

    国内研究者によるパネルディスカッション2021

    ~誰でも使える無料のQIAseq RNA-seq Analysis Portalの実際について~

    演題：みんなで考えるRNA-seqデータの新しい価値
    座長：京都大学大学院医学研究科 渡辺 亮 先生
    演題/演者

  • 奈良先端科学技術大学院大学 笹井 紀明 先生
    視神経系の発生に関与する遺伝子Rxの機能解析

  • 名古屋大学大学院医学系研究科　新城 恵子 先生
    皮膚の良性疾患であるケロイドと正常瘢痕を規定する分子メカニズムの同定

  • 国立研究開発法人理化学研究所 福原 武志 先生
    PARK2遺伝子欠損マウスの老化脳に対するRNA-seq解析

  • 東京慈恵会医科大学　柳垣 充 先生
    低酸素、低栄養、オートファジーへの介入による膵臓癌細胞株における 遺伝子発現量の変化

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    RNA-seq Analysis Portal / QIAseq UPX 3’Transcriptome Kits

    オンデマンドウェビナー

    国内研究者によるパネルディスカッション2022

    RNA-seqデータから仮説を導きだすために

    製品のご紹介　株式会社キアゲン 嶋多涼子

    実験工程のご紹介　株式会社ダナフォーム 山口 格 様


    演者/演題

  • 国立研究開発法人国立がん研究センター研究所 武田 はるな 先生
    「網羅的発現解析による大腸がん悪性化経路の解明」

  • 金沢大学ナノ生命科学研究所　　平尾 敦 先生
    「がんの治療耐性と細胞休眠」

  • 長崎大学大学院医歯薬学総合研究科 　　松尾 友紀 先生
    「骨芽細胞分化誘導シグナル経路の解明」

  • 京都大学高等研究院ヒト生物学高等研究拠点　村川 泰裕 先生
    「腎細胞がんサブタイプのトランスクリプトーム解析」

  • 九州大学大学院歯学研究院　吉崎 恵悟 先生　
    「歯をモデルとして細胞間コミュニケーションによる形態形成機構を明らかにする」

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    QIAseq FastSelect Kits / QIAseq miRNA Library Kit

    オンデマンドウェビナー

    感染症におけるRNA-seqの重要性

    Day 1
    演題：感染症研究におけるrRNA 除去の重要性
    – 既存のRNA-seq ワークフローでより効率的なトランスクリプトーム解析を目指して –　
    演者：株式会社キアゲン 伊知地 稔

    Day 2
    演題：感染症におけるmiRNA変動解析の重要性
    – 分子バーコード技術による正確かつ網羅的な miRNA-seq –　
    演者：株式会社キアゲン 小出 清乃

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    QIAseq miRNA Library Kit

    Liquid Biopsy Webinar

    NGSによるmiRNA 解析に最適なライブラリー調製試薬のご案内

    大阪大学 MMDS 野島 陽水　先生
    大規模コホートにおけるオミックスデータ収集プロトコールの選定について


    株式会社キアゲン　嶋多 涼子
    NGSによるmiRNA 解析に最適なライブラリー調製試薬のご案内

    視聴はこちら
    QIAseq FastSelect Kits

    オンデマンドウェビナー

    RNA-seq 最適化において重要なrRNA 除去

    QIAseq FastSelect Kits 製品を用いれば、RNA-seq のライブラリー構築に1ステップ追加するだけで、NGS で得られる生物学的に重要なデータ量の割合を大きく増やすことが可能です。 本ウェビナーでは、QIAseq FastSelect Kitsで始めるRNA-seq データの有効活用についてご説明します。

    演者：株式会社キアゲン 中村 翔太

    視聴はこちら

    QIAseq RNA-seq Library kit 受託会社のご紹介

    シークエンサーをお持ちでないお客様には、以下3 社の受託会社にてサポート頂けます。

    詳細をみる

    テクニカルサポートチームが考えるRNA精製キットのポイント

    詳細はこちら
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